科学的过渡阶段往往伴随着残酷的否定阶段，不管是什么养的科学种类都逃不过这个环节。

达尔文进化论是19世纪中叶，达尔文创立了科学的生物进化学说，以自然选择为核心，第一次对整个生物界的发生、发展，作出了唯物的、规律性的解释，推翻了神创论等唯心主义及形而上学在生物学中的统治地位，使生物学发生了一个革命变革。

在文艺复兴以及思想启蒙之后，现代科学的理性思维已经建立起来。达尔文的时代是十九世纪中后期，正是走出蒙昧，提倡科学的前一阶段，在思想和理性上，为达尔文创立自然选择进化论提供了思想依据。而青年时的远游，则为他积累了大量的实据，引发了他关于物种进化的思考并最终形成一个完整的体系。不可否认，由于当时科学不太发达，进化论存在理论缺陷，可随着科学的不断进步，进化论已经发展成现代综合进化论了。

其实反对进化论的目的只有一个——引出神。现在这些反对进化论人士已经很隐晦了，不直接说神造，而是智能设计论，可物种如何出现的问题只有两种可能，一是自然演化，一是被创造。即使我们地球的生命是被外星人创造的，那么外星人从哪儿来依然是一个问题，依然存在是进化还是被创造的问题，因此，考虑宇宙中的生命，依然只存在自然演化与被创造两种可能。

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